Поздний ответ ... надеюсь, кто-то найдет его полезным ...
Существует инструмент от Red Gate под названием SQL Multi Script, который может выполнять сценарии для того, что вам нужно. Не уверен, что он существовал, когда был задан вопрос :)
Еще одна хорошая вещь - это инструмент сборки SQL от ApexSQL , который также может выполнять любые вставки и другие сценарии ...
Отказ от ответственности: я не связан ни с одной из компаний, упомянутых выше.