Краткий ответ: да.
Длинный ответ, как и почти на каждый вопрос, «это зависит». Зависит от операционной системы, программного обеспечения, версии процессора и т. Д. Мне лично приходилось два раза отключать гиперпоточность для правильной работы программного обеспечения (один с приложением Synergy и два с установщиком Windows NT 4.0), но ваш пробег может варьироваться.
Пока вы устанавливаете Windows, обнаруживающую несколько ядер HT с самого начала (загружаются некоторые соответствующие драйверы и тому подобное), вы всегда можете отключить (и снова включить) HT "по факту". Если у вас возникают странные проблемы со стабильностью работы с конкретным программным обеспечением, которые вы не можете устранить, отключить HT несложно, чтобы увидеть, имеет ли он какое-либо влияние.
Я бы не стал отключать его для начала, потому что, честно говоря, он, вероятно, будет хорошо работать в 99,99% вашего ежедневного использования. Но имейте в виду, что да, это может иногда вызывать странное поведение, поэтому не исключайте этого, если вам случится найти неисправность в чем-то очень странном в будущем.