Мне нравится думать, что они нацелены на две разные цели.
Я написал PHPXref более десяти лет назад как быстрый взлом, который позволил мне быстро и легко освоить исходный код большого проекта, не требуя большого количества инструментов (только Perl, и даже не так, если вы ') на Windows) и без необходимости удаленного веб-сервера. Часть документации была полезным побочным эффектом, но на самом деле я просто хотел достойный способ чтения через гиперссылку исходного кода в браузере.
PHPDocumentor и аналогичные инструменты значительно лучше справляются с генерацией реальной документации из различных форматов.
PHPXref может определенно использовать некоторые обновления (или переписать), но все равно должен быть полезен сегодня - вы можете загрузить его и получить вывод без конфигурации через пару минут, поэтому дешево посмотреть, подходит ли оно вашим потребностям. 1007 *