Преобразователи JSDoc, о которых я знаю, написаны на JavaScript и жестко запрограммированы для создания тегов HTML.
Лучший конвертер HTML-> PDF, о котором я знаю, это WKHTMLToPDF . Он использует веб-набор для рендеринга PDF вместе с библиотекой PDF QT.
Так что для запуска нужна какая-то * среда NIX.
Существует довольно много других, некоторые приложения, некоторые сервисы. Вы можете искать вопросы здесь для более полного списка.