Не уверен, почему вы отметили Codeigniter в качестве своего решения, поскольку у него вообще нет каскадной файловой системы. Конечно, он имитирует один с настройкой контроллера, но на этом все заканчивается.
Полагаю, вы либо не уверены, что искали, либо не проверяли, действительно ли Codeigniter соответствует вашим требованиям.
В любом случае, взгляните на FuelPHP , фреймворк, вдохновленный как Kohana, так и Codeigniter.
Он принял каскадную файловую систему Kohana и использовал новые функции PHP 5.3, такие как пространства имен, что означает, что вы не можете использовать его в более старых версиях PHP.
Хотя он все еще очень новый, я уже использовал его в одном проекте и был очень доволен этим. Единственное, что мне не понравилось, это ORM, который они использовали, то же самое, что и Kohana. Это сильный ORM, но его использование не очень интуитивно понятно.