Веб-часть вашего приложения может легко прочитать файл или базу данных, поэтому вам просто нужно убедиться, что ваши сценарии оболочки выводят что-то для обновления вашего Java-кода.
Например, если вызапустите свой скрипт оболочки следующим образом:
./myscript.sh > mylog.log
Затем в своем коде Java (обратите внимание, что в вашем JSP не должно быть логики) вы можете прочитать файл, чтобы определить состояние обновления, и вывестирезультат для вашего JSP.
Было бы лучше прочитать данные из базы данных, но это потребовало бы изменения сценария оболочки для вывода данных в базу данных.