Библиотека JSch содержит класс ChannelSftp .Этот класс имеет (между другими) также методы для
- копирования удаленных файлов в локальные (все методы
get
) - удаления удаленных файлов (метод
rm
илиrmdir
для удаления пустых каталогов) - список удаленных файлов (
ls
)
Все ваши требования могут быть выполнены с помощью комбинации этих методов.