Вы можете попробовать неинициализировать свой экземпляр, а затем снова начать инициализацию.
Сброс инициализации с помощью:
ActiveRecordStarter.ResetInitializationFlag();
Для второй инициализации вы можете указать другой файл конфигурации, если вы используете XmlConfigurationSource, или передать новую строку подключения, если вы используете InPlaceConfigurationSource.
Этот метод обычно используется в тестовых случаях, когда вы создаете свою схему, запускаете тест, затем разрушаете и запускаете снова, но здесь это может быть уместно.