Если вы уже используете Eclipse 3.4 и имеете функциональную рабочую среду и довольны ею, оставайтесь с этим, поскольку многие мелочи меняются от выпуска к выпуску.
Существует множество новых возможностей, которые могут вас заинтересовать, но не обязательно что-либо, требующее улучшения.Вы можете без проблем установить версию 3.6 рядом с установкой версии 3.4, чтобы вы могли испытать ее, одновременно работая с 3.4.