Я пытаюсь написать библиотеку, чтобы сделать что-то специфичное для домена. Я хотел бы добавить в эту библиотеку несколько сценариев, которые можно запускать прямо из командной строки.
Макет каталога:
+- project.clj
+- src/
| +- my-lib.clj
| +- my-lib/
| +- my-sub-1.clj
+- scripts/
+- run-command.sh
Файл src / my-lib.clj загружает файл my-lib / my-sub-1.clj:
(ns my-lib
(:use [my-lib.my-sub-1])
)
Файл src / my-lib / my-sub-1.clj содержит функции, которые я хочу сделать доступными. Одна из этих функций называется «конвертировать» и принимает два аргумента: имя входного файла и имя выходного файла; он преобразует формат файла. Чтобы использовать это:
(convert "input-file.txt" "output-file.txt")
Функции (делать что-то интересное) и (конвертировать) в src / my-lib / my-sub-1.clj выглядят так:
(defn do-something-interesting
[input-file output-file]
(magic-happens-here input-file output-file))
(defn convert
[args]
(let [infile (first args)
outfile (second args)]
(do-something-interesting infile outfile)))
Моя цель на данный момент: создать скрипт «run-command.sh» в каталоге «scripts», который принимает два аргумента: имя входного файла и имя выходного файла. Должно быть возможно запустить скрипт с:
./run-command.sh input-file.txt output-file.txt
У меня действительно работает run-command.sh, если я жестко закодирую имена файлов в этом скрипте, используя функцию (делать что-то интересное) вместо (конвертировать). Я еще не смог прочитать из списка аргументов ...
Работающий скрипт run-command.sh:
#!/bin/sh
java -cp "../lib/*":"../src":$CLASSPATH clojure.main -e "
(use '[my-lib my-sub-1])
(do-something-interesting "path-to-input-file" "path-to-output-file")
"
... но что не работает:
#!/bin/sh
java -cp "../lib/*":"../src":$CLASSPATH clojure.main -e "
(use '[my-lib my-sub-1])
(convert *command-line-args*)
"
Я получаю ошибку:
Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException: No implementation of method: :reader of protocol: #'clojure.contrib.io/Streams found for class: nil (NO_SOURCE_FILE:0)
at clojure.lang.Compiler.eval(Compiler.java:5435)
at clojure.lang.Compiler.eval(Compiler.java:5386)
at clojure.core$eval.invoke(core.clj:2382)
at clojure.main$eval_opt.invoke(main.clj:235)
at clojure.main$initialize.invoke(main.clj:254)
at clojure.main$null_opt.invoke(main.clj:279)
at clojure.main$main.doInvoke(main.clj:354)
at clojure.lang.RestFn.invoke(RestFn.java:422)
at clojure.lang.Var.invoke(Var.java:369)
at clojure.lang.AFn.applyToHelper(AFn.java:165)
at clojure.lang.Var.applyTo(Var.java:482)
at clojure.main.main(main.java:37)
Caused by: java.lang.IllegalArgumentException: No implementation of method: :reader of protocol: #'clojure.contrib.io/Streams found for class: nil
at clojure.core$_cache_protocol_fn.invoke(core_deftype.clj:471)
at clojure.contrib.io$eval32$fn__33$G__23__38.invoke(io.clj:118)
at bioclojure.vcf$header.invoke(vcf.clj:22)
at bioclojure.vcf$column_header.invoke(vcf.clj:55)
at bioclojure.vcf$column_names.invoke(vcf.clj:61)
at bioclojure.vcf$vcf2tsv.invoke(vcf.clj:169)
at bioclojure.vcf$convert.invoke(vcf.clj:185)
at user$eval474.invoke(NO_SOURCE_FILE:3)
at clojure.lang.Compiler.eval(Compiler.java:5419)
... 11 more
Я пытался "использовать" файл clojure.contrib.io в самом файле сценария run-command.sh и в верхнем библиотечном файле my-lib.clj, но пока не повезло ...
Если бы кто-нибудь мог мне помочь, это было бы здорово.
Январь