В документации для Prism 2.1 сказано, что требуется VS 2008.
Чтобы использовать Prism 4, необходимо обновить систему до VS 2010.
Но возможно ли продолжать разработку с использованием Prism2.1, если вы обновляетесь до VS2010?
Да, вам просто нужно нацелиться на .Net 3.5.