Вам не хватает аргумента для вызова функции count (), и вам не хватает и И (или ИЛИ) перед ReferenceType = 1
((SELECT COUNT(*)
FROM References
WHERE DocumentID = 15354
AND CustomerID = 896
AND ReferenceType = 1) +
(SELECT COUNT(*)
FROM References
WHERE DocumentID = 15354
AND ReferenceType = 0)) AS TotalReference
Кроме того, рассматривали ли вы возможность повторного подсчета только в одномподзапрос?
(SELECT COUNT(*)
FROM References
WHERE DocumentID = 15354
AND ((ReferenceType = 1 AND CustomerID = 896)
OR (ReferenceType = 0))) AS TotalReference