Вы можете добавить веб-сервис в ваше приложение mvc, в конце концов, он (mvc) является asp.net.
Если он находится в корне вашего приложения, вы можете просто вызвать его (веб-сервис), еслиПоместите его в подкаталог, я думаю, вам нужно создать маршрут игнорирования (например, по умолчанию routes.IgnoreRoute("{resource}.axd/{*pathInfo}");), но я не уверен, что маршрут игнорирования необходим.