Вы можете использовать hibernate.connection.autocommit = true
Это заставит hibernate зафиксировать каждое обновление SQL в базе данных немедленно, и вы сможете увидеть изменения из другого приложения..
ОДНАКО, я настоятельно рекомендую вам не делать этого.Как отметил Аарон, вы должны использовать только один Hibernate SessionFactory с базой данных.
Если вам нужно синхронизировать несколько приложений, подумайте об использовании общего кэша, например Gemstone.