Вам придется клонировать весь репозиторий во время развертывания, а затем переместить файлы туда, куда вы хотите, чтобы они были развернуты, или клонировать в родительский каталог, чтобы файлы были на месте.Например, следующая команда клонирует весь репозиторий git в папку www, поэтому, если ваш подкаталог должен находиться в каталоге www / path / to /, в вашем репозитории git должен быть идентичный путь / каталог / to:
git clone git@github.com:username/app.git www