Я просто поставил драйвер (ы) на classpath
при запуске сервера:
classpath=.:/opt/h2/bin/h2.jar:/opt/derby/lib/derby.jar:...
server=org.h2.tools.Server
java -cp ${classpath} ${server} -tcp -web ... &
Кроме того, это один из редких случаев, когда вы можете добавить JAR
к одному из java.ext.dirs
. Вы можете увидеть, что доступно на вашей платформе:
System.out.println(System.getProperty("java.ext.dirs"));