NullUserException является правильным. Это должно быть вашим первым выбором. Винсент и Майкл отлично работают с этими "портами" пакетов Debian, которые я поддерживаю. На самом деле я сам использую эти «портированные» пакеты на машинах с Ubuntu.
Если вы хотите использовать стандартный дистрибутив Ubuntu, все также будет работать. Вы, должно быть, делаете что-то не так (и вы не показали, что сделали), поскольку install.packages() прекрасно работает с зеркалами CRAN, независимо от того, запускаете ли вы двоичный файл R из Ubuntu или репозиторий CRAN-for-Ubuntu, на который есть ссылки выше.
Более того, вы также можете работать из исходных текстов - фактически, многие из нас разрабатывают наши пакеты для Ubuntu и / или Debian.
Наконец, для подобных вопросов, список r-sig-debian является отличным ресурсом с дружелюбными и своевременными ответами на R на вопросы Debian / Ubuntu. Подпишитесь, прежде чем отправлять сообщения.