Чтобы указать символ буквальной кавычки, экранируйте его, используя стандартный символ \
:
UPDATE `main` SET Practice = replace(Practice,"\"","");
Вы также можете использовать одинарные кавычки, чтобы избежать необходимости использовать escape-символ:
UPDATE `main` SET Practice = replace(Practice,'"','');