A относится к версии, на которой основана цель слияния. Если вы сливаетесь из ветви в транк, то A будет предыдущей версией транка.
B - это то, что у вас есть в локальной папке внешних линий, включая локальные изменения.
C - это версия, которую вы хотите объединить поверх B.