Я полагаю, что есть лучший способ, но вы всегда можете просто использовать индекс для графика и затем назначить даты в качестве меток:
p <- qplot(1:3, 1:3, geom='line')
p + scale_x_continuous("", breaks=1:3, labels = as.Date(c("2010-06-03", "2010-06-04", "2010-06-07")))