Если вы собираетесь использовать Mootools, тогда вам действительно следует использовать методы Mootools, а не переключаться между ним и ванильным Javascript. Одним из преимуществ этого является то, что Mootools уже позаботится о несоответствиях браузера для вас. Поэтому, если вы игнорируете его методы, вам придется позаботиться о них самостоятельно.
Чтобы получить доступ к свойствам элемента способом Mootools, вы можете использовать методы set и get для любого элемента. Функция dollar ($) возвращает элемент, поэтому вы можете просто установить цепочку и перейти к ней.
//returns selectId's HTML
var foo = $('selectId').get('html');
//Sets the HTML of selectId to <option>Test test</option>
$('selectId').set('html', '<option>Test test</option>'); //
В этом случае вам просто нужно использовать set.
Одна вещь, о которой вы должны знать, это то, что она не добавляет опцию в блок выбора, а вместо этого заменяет все внутри блока выбора опцией. Следовательно, если вы хотите использовать это для добавления нескольких параметров в поле выбора, оно не будет работать, поскольку вы каждый раз сбрасываете HTML. Не имеет смысла иметь поле выбора, которое имеет только одну опцию, поэтому я предполагаю, что вы пытаетесь добавить опцию, а не заменять все опцией. В этом случае сделайте следующее:
//get the current options selectId's options
var options = $('selectId').get('html');
//Add your own option onto the end
options = options + '<option>Test test</option>';
//Set the HTML of selectId to whatever is stored in options
$('selectId').set('html', options);