was6-maven-plugin работает для меня на WAS7 без проблем, но вам нужно взломать, если вы хотите развернуть несколько EAR из одного модуля Maven.
У вас нет возможности развернуть несколько EAR, как в плагине Geronimo, где вы можете указать несколько идентификаторов артефактов.
was6-maven-plugin имеет earFile со значением по умолчанию ${project.artifact.file}