Я думаю, это зависит от версии mootools (это очень хорошо!).Кажется, что он использует mootools 1.2 (последняя версия 1.3), и поэтому в IE9 могут возникнуть некоторые проблемы.
http://mootools.net/demos/ ссылается на Form.Validator, который находится внутриpackage.
Однако я не думаю, что formcheck будет работать в IE9 Beta.Я бы написал разработчику о проблеме;)