Хотя я не нашел разумного решения для отладки, я обнаружил, что это было связано с обновлением nant. Старый работающий скрипт начал работать с ошибкой «дублирующая цель». Это было связано с тем, что файл задачи был включен в 2 других файла, уже включенных в проект. Нант нашел два разных пути к одной и той же задаче и подумал, что это две разные задачи и, следовательно, перевернулся.