Server 2008 был выпущен задолго до .NET 4, ядро ОС ничего не знает о .NET 4, если вы не установили его явно.И он все еще не будет указан в диспетчере серверов |Возможности.
Server 2008 просто перечислит 3.0 (текущая версия .NET, когда она была выпущена, Server 2008 R2 перечисляет 3.5.1 (как вы упомянули IIS7.5, кажется, что выфактически использует Server 2008 R2).
После установки .NET 4 вы можете создать (или использовать) один из пулов приложений .NET 4 для своего приложения.