Зачем тогда использовать iframe?Воткни все это в другой контейнер.Я не могу думать ни о каком преимуществе iframe, за исключением того, что вы можете загрузить страницу из атрибута src.
Я полагаю, если вам нужен iframe для каких-то других целей, например, вы загружаете страницу, но хотитечтобы заменить его ответом ajax, вы можете использовать jQuery для замены iframe для div и обратно при необходимости.
Другая возможность состоит в том, что вместо ajax измените ваш php-скрипт ajax для вывода полногостраница, которую вы хотите в iframe.Затем с помощью jQuery измените адрес запрашиваемой страницы в iframe, добавив новые параметры для отображения обновленного содержимого.