Размещение его на поддомене не имеет проблем с безопасностью, связанных с концепцией, так как обработка платежей на вашем веб-сайте на самом деле ничего не значит в плане обработки платежей. Все обычные проблемы безопасности остаются в силе, независимо от того, где вы разместили их на своем сайте.
Здесь также нет никаких реальных преимуществ, за исключением того, что, возможно, вам нужно всего лишь получить сертификат SSL для этого субдомена, при условии, что он вам больше не нужен на вашем веб-сайте. Но это едва ли выгодно, если он вообще есть.