Вам необходимо иметь отдельные теги сценария с атрибутом src, установленным для обоих файлов javascript в документе HTML, при условии, что это для страницы HTML (а не для приложения AIR, серверного JavaScript или Rhino). Какие бы функции вы ни объявили в глобальной области видимости в любом файле JavaScript, который вы добавляете через элемент script или встроенный код, он должен быть доступен для JavaScript в любом файле.
Единственное предостережение в том, что если вы используете синтаксис window.foo для назначения чего-либо глобальной области (окна) в файле, то, к удивлению в IE, другие файлы будут думать, что window.foo не назначен до тех пор, пока JavaScript не начнет выполняться.
Подробнее о последнем выпуске