Вы не можете писать в файлы, используя Javascript из-за проблем безопасности.Есть способы сделать это в Internet Explorer, используя элементы управления ActiveX, но, поскольку это не переносимо, я бы не рекомендовал это делать.Кроме того, существует HTML5-кэширование в автономном режиме, но это не то, что вам действительно нужно.
Короткая версия: вы не можете записать файл непосредственно на жесткий диск клиента.Либо напишите его на своем сервере, если вам нужно, либо предложите этот файл для загрузки клиенту.
И, как упоминал Koekiebox, в вашем коде есть только одна строка Java, и это
<%@ page import="java.io.*" %>
Все остальное - Javascript, и Javascript ничего не знает о java.io.*
.