Объектная модель лучше, так как вы можете получить доступ к дополнительным функциям и полным деталям элементов списка, таких как история версий.
Объектная модель также лучше для производительности (при условии, что вы правильно удаляете () объекты spsite и spweb).
Объектная модель Sharepoint имеет некоторые различия между 2 и 3, но если вы посмотрите на ссылку для v2, то она также будет полностью работать с v3.
Веб-службы вообще не изменились между v2 и v3, что объясняет, почему у них нет никаких новых функций v3.
Причина, по которой объектная модель выиграет в производительности, заключается в том, что вы не будете сериализовывать данные в формате Xml, а затем передавать большую часть Xml и затем десериализовать Xml. Объектная модель экономит вашу память и пропускную способность.