Другой причиной (которая была у меня) могут быть зависимости.
В обозревателе решений щелкните правой кнопкой мыши по проекту автозагрузки - Зависимости сборки - Зависимости проекта.
Если проект, над которым вы работаете, не установлен как зависимость от проекта запуска, то он не будет собран при запуске F5 /.