Привет, может быть, вам стоит взглянуть на опции all.x или all.y в функции слияния.
Data1 <- data.frame(ID = rep(c(1,2), each = 3),
Time = rep(c(1, 2, 3), 2))
Data2 <- data.frame(ID = c(1, 2, 2),
Time = c(2, 1, 3),
X = c(2, 3, 4))
merge(Data2, Data1, all.y = TRUE)
ID Time X
1 1 1 NA
2 1 2 2
3 1 3 NA
4 2 1 3
5 2 2 NA
6 2 3 4
или с помощью функции plyr join, которая быстрее, чем merge, но не имеет некоторых опций:
join(Data2, Data1, type = "full")
Joining by: ID, Time
ID Time X
1 1 2 2
2 2 1 3
3 2 3 4
4 1 1 NA
5 1 3 NA
6 2 2 NA