Отзыв сертификатов не влияет на существующие приложения (AppStore / AdHoc / Dev).
Восстановите свои профили обеспечения (убедитесь, что новый сертификат отмечен в списке сертификатов). Тогда вам просто нужно будет подписать обновления с помощью нового профиля обеспечения.
Вы можете настроить новый сертификат на другом компьютере, если хотите.