Нет необходимости использовать ARCHFLAGS. Как сопровождающий, я считаю каждую такую необходимость ошибкой. Предпочтительным способом является наличие mysql_config в вашем PATH. Если это так, то компиляция должна быть успешной (если у вас правильно установлен MySQL).
Другой потенциальной причиной проблемы может быть то, что ваша установка MySQL является 32-битной, а не 64-битной. Вы можете проверить это, выполнив (пожалуйста, используйте правильный путь):
файл / путь / к / вашему / bin / mysql
Это должно вывести что-то вроде:
Mach-O 64-битный исполняемый файл x86_64