Я бы:
1) Переименуйте проект в решении.
2) В свойствах проекта переименуйте свойство «Assebly name»
3) Удалить проект из решения
4) Закройте решение
5) Переименовать / переместить папку проекта
6) Раскройте раствор
7) Добавить существующий проект в решение
8) Восстановить правильные ссылки
9) Удалить старые решения и файлы проекта из новой / переименованной папки
если я понял вопрос (при условии, что несколько проектов находятся в одном решении) ..