Самый простой способ - с юридическим лицензионным соглашением (то есть тем, которое вы платите адвокату, который специализируется на таких вещах, чтобы писать). Да, найдутся люди, которые проигнорируют это и в любом случае будут запускать нелегальные копии, но это произойдет независимо от того, что вы делаете. Вам просто нужно сконцентрироваться на предоставлении достаточно хорошего сервиса (то есть продаж и поддержки), чтобы люди хотели заплатить за него.
Больше, чем это, и вы просто будете раздражать законных пользователей (что влияет на вашу способность предоставлять "хороший сервис").