По своему опыту я бы сказал, что это не вызовет никаких проблем.
Поскольку это проект PHP, ваш рабочий код и код на сервере будут одинаковыми, за исключением нескольких файлов конфигурации.
Однако, учитывая разработку в целом, лучше дать сборку, чем прямую синхронизацию кода из репозитория в оперативную папку. Для проектов PHP сборка очень проста, просто скопируйте всю папку в каталог www. Для проектов, разработанных с использованием других технологий, вам может понадобиться скомпилировать код и внести серьезные изменения в настройки.
Поэтому лучше оставить код в папке www как есть, и обновлять его только сборкой, а не прямым обновлением из репозитория SVN.