Представление - это только HTML-код, который будет отображаться. Это самая последняя вещь, которая обрабатывается. Сначала вызывается контроллер, затем он вызывает все необходимые модели. После передачи всех данных представлению отображается HTML представления.
Вкратце: что бы вы ни включали в представление, контроллер не знает об этом. Вы должны запустить свой PHP, включенный ранее в коде. Если вы делаете это в контроллере, он должен работать нормально, я полагаю (не проверял, поэтому я ничего не гарантирую).