Вы можете синхронизировать папку проекта вместо всего рабочего пространства.
Если вы хотите поделиться несколькими проектами, вы можете поместить их в подпапку вашего рабочего пространства и поделиться только этой подпапкой.
Кстати, я рекомендую вам использовать настоящий SCM, такой как GIT или SVN, который дает вам возможность игнорировать некоторые файлы / директории.