Надеюсь, я правильно понял ваш вопрос.
У вас есть несколько веб-сайтов, которые указывают на один и тот же каталог.Вы хотите указать другой документ по умолчанию для этих сайтов.
В IIS7
Select the website -> Default Document
В разделе «Действия» справаДобавьте нужный документ по умолчанию и удалите существующие.