Вы можете запустить сервер Java на любом порту, который хотите. Каждый сервер будет принимать входящие запросы на один порт.
Правильный способ - просто запустить на одном порту, и каждое соединение будет создавать новый экземпляр сервлета (который выполняется в своем собственном потоке), который затем сможет обслуживать этот запрос. Как правило, вам не нужно запускать отдельные порты или беспокоиться о параллелизме, особенно если все содержимое, которое разделяется между подключениями (например, несколько игроков в одной игре), обрабатывается посредством чтения / записи в базу данных.
Ваш хост (GoDaddy) должен будет разрешить вам использовать эти порты, но если они предоставляют надлежащий хостинг (не виртуальный хостинг) и предоставляют вам свой собственный IP, нет причины, по которой вы не сможете этого сделать.