Это зависит от системы.Windows имеет централизованное хранилище сертификатов, в то время как другие платформы этого не делают (по крайней мере, нет единой).Таким образом, запрос системных сертификатов зависит от платформы.И как бы то ни было, было бы разумно искать JNI для API для конкретной платформы, чтобы делать то, что вам нужно.
Полагаю, для Windows уже должен быть какой-то класс (скорее всего, работающий через JNI), но я его никогда не видел.Я бы тоже заинтересовался таким решением (для конкретных целей, где JNI нельзя использовать).