protected void gv_RowUpdating(object sender, GridViewUpdateEventArgs e)
{
GridViewRow row = GridViewName.Rows[e.RowIndex];
row.CssClass = "some class that has background-color set";
}
Это должно (также не проверено) работать, если вы явно не установили цвет фона каждой ячейки.
Примечание. Я понимаю, что вы указали jQuery, но, поскольку вы опубликовали функцию на стороне сервера, я подумал, что это проще.