Встроенные функции BCMath не имеют отношения к объектам BCMath как таковым, они просто обрабатывают строки для достижения вычислений произвольной точности. Таким образом, вы можете преобразовать обратно в нативный php int с обычным приведением.
$val = (int) bcmod( bcpow( "9392", "394" ), "100" );
С http://php.net/manual/en/book.bc.php, подписи метода
string bcmod ( string $left_operand , string $modulus )
string bcpow ( string $left_operand , string $right_operand [, int $scale ] )