Вы не можете разделить рабочее пространство.Вы можете создать столько рабочих пространств, сколько захотите, и добавить туда столько проектов, сколько захотите.Чтобы создать новое рабочее пространство, просто создайте каталог, а затем запустите eclipse и передайте ему этот каталог в качестве рабочего пространства.Это все сделает автоматически.
К сожалению, ваш второй вопрос неясен.