Когда вы устанавливаете сигналы тревоги, у вас есть два раза: время первого запуска и следующий интервал запуска.
Затем необходимо рассчитать оставшиеся миллисекунды до следующей вершины часа, а затем установить один час для повторяющегося интервала.
// We want the alarm to go off 30 seconds from now.
long firstTime = SystemClock.elapsedRealtime();
firstTime += remainingMilisecondsToTopHour;
long a=c.getTimeInMillis();
// Schedule the alarm!
AlarmManager am = (AlarmManager)ctx.getSystemService(Context.ALARM_SERVICE);
am.setRepeating(AlarmManager.ELAPSED_REALTIME,
c.getTimeInMillis(), 1*60*60*1000, sender);