Во-первых, и это большое предостережение, более или менее нет способа сделать правильную синхронизацию во флэш-памяти. Это потому, что вы почти всегда выполняете свой код в потоке пользовательского интерфейса. Поток пользовательского интерфейса отвечает за рендеринг кадров, который может занять некоторое время для сложных кадров, в результате чего частота кадров фактически снижается. Однако существует множество причин, по которым флэш-плеер может отображать меньше кадров при определенных условиях. Например, многие браузеры имеют тенденцию выделять меньше ресурсов для экземпляров Flash Player (и других плагинов), которые находятся на неактивной вкладке или в свернутом окне. Однако я не знаю ни одного браузера, который бы намеренно замедлял работу флеш-памяти в активной вкладке / окне. Эта статья может предоставить больше информации.
Теперь, чтобы решить вашу актуальную проблему. Я бы посоветовал вам проверить свой код встраивания в html, возможно, там установлено другое значение частоты кадров, которое может помешать тому, что вы установили в своем фильме. Вот почему он работает, как и ожидалось, в автономном проигрывателе, но не при его установке.