Поскольку вы не предоставили никакой информации об этом в своем вопросе, я предполагаю, что у вас есть учетные данные в строке подключения.
С точки зрения безопасности вам следует избегать этого, по возможности использовать проверку подлинности Windows. Очевидно, что для этого требуется, чтобы у вас был доступ к среде Active Directory, и в ней были развернуты все серверы.
Если нет, всегда лучше заблокировать веб-сервер, чем пытаться убедиться, что файлы на диске защищены от подделки различными пользователями.
Если даже это невозможно, я бы следовал подходу, данному в других ответах, зашифровывая конфиденциальный контент с помощью DPAPI.