Клиентская часть JAX-WS является частью стандартного Java API, и эталонная реализация надежна и эффективна, в то время как Axis требует сторонних зависимостей.Если вам не нужны какие-либо функции, реализованные Axis и не предлагаемые JAX-WS, я действительно не вижу причин, по которым вам следует выбирать Axis, а не JAX-WS.