Вы можете использовать Rhino, который является Javascript-средой исполнения, написанной на Java (IIRC, командная строка выглядит как java -jar Rhino.jar script.js).Это особенно полезно, если ваши тесты не требуют браузера.
Не забудьте проанализировать свой код JS с помощью JSLint!